会计系的前身为聊城市财政学校，创建于1986年9月，1988年经山东省人民政府批准为全日制普通中专学校。
会计专业是建校初期设立的重点专业之一。专家施教，面向初、高中毕业生零起点教学，在校期间能考取会计证、助理会计师。为财政、税务、工商、审计、银行、保险及企业培养了数以万计的优秀财会工作者。他（她）们有的成为单位负责人、财务总监、总会计师、会计主管，担负着会计师、税务师、经济师、审计师、评估师等重要职责；有的将平生所学融于社会，成为懂管理、会核算的精明老板。聊城市财政学校是鲁西规模最大、师资力量最强、最受社会欢迎的以会计专业为主的财经类职业学校，在社会上享有广泛信誉。为满足社会需求，对招收的高中毕业生专设会计师班。会计专业的在校生人数一度达到3200多人。“学会计，上财校”成为了鲁西大地家喻户晓的广告词。
2009年8月，聊城市人民政府整合全市中职教育资源，将聊城市财政学校与其他四所市直中职学校进行合并，更名为聊城高级财经职业学校，聊城市财政学校被称为聊城高级财经职业学校二校区。2013年9月，学校成立了会计系。会计系建有会计电算化实训室、erp沙盘模拟实训室和会计手工模拟实训室及最先进的教学软件。
会计系拥有一支实力雄厚、结构合理、优良优质、爱岗敬业、勇于创新的师资队伍。现有教职工82人，其中具有高级职称的教工16人，具有中级职称的教工22人，注册会计师1人；市级以上优秀教师8人，在校生人数达1360人。
会计系坚持以服务为宗旨、以就业为导向、以能力为本位，突出教学过程的实践性和职业性，全面推进职业素质和专业技能的培养。在专业建设中，教学内容、教学方法和课程体系的改革是提高教学质量的关键。始终注重理论教学、实际操作及技能训练，使学生掌握扎实的基础理论和专业知识，具备从事实际工作的基本技能。在教学中注重与会计职业考证相衔接，使毕业生获取“双证书”，提升就业竞争能力。十分注重学生人文素质的培养，坚持开展丰富多彩的文体活动，在山东省中职学校技能大赛和教育部主办的全国中职学校文明风采大赛中屡获殊荣。
会计专业定位于生产服务一线技能型会计人才培养，主要培养适应新时期经济建设发展需求的具有综合职业素质和创新能力，在基层企事业单位从事会计核算与会计事务管理工作以及商业和服务企业收银、统计、库管、营销管理等方面工作的技能人才。学生毕业双证书（毕业证、会计证）率力争达到100%。真正实现“一出校门即可上岗”的零对接教学目标。
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